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实验八 聚合酶链式反应-限制酶片段长度多态(PCR-RFLP)
2015-07-25 12:05  

      案 首 页

 

2013级  生物技术专业本科班                              任课教师: 张坤    

课程

遗传学实验技术

题目

  实验八(一)聚合酶链式反应-限制酶片段长度多态(PCR-RFLP

学时

讲授

 

实验

3

练习

 

行课时间

20157月 2日第6-8

课次

8

教 材

《医学遗传学实验指导》第3版,主编:王修海,科学出版社,2012

教 具

教学PPT

教 学

目 的

要 求

1、掌握PCR-RFLP技术的原理

2、熟悉PCR-RFLP技术步骤

3、了解PCR-RFLP应用及意义。

 

教学重点

难点及其

解决方案

重点:PCR-RFLP的原理及应用

 

难点:PCR-RFLP结果判断

 

解决方案:讲解、列表、举例

 

参 考

资 料

1、杨抚华.医学生物学(第七版).北京:科学出版社,2011

2、梁素华.医学遗传学(第三版).北京:人民卫生出版社,2013

实 施

情 况

小 结

 

 

教研室主任签名:                                                  月    

      案 续 页

教学过程、内容及时间分配

教学方法与手段

课前复习(1min)

     首先评讲上节课的实验报告。点名表扬95分以上同学的实验报告,并挑选95分以上同学的实验报告作为示范,请全班同学观摩。

 

新课引入(1min)

     DNA链内发生的点突变及片段缺失、重复、插入等变异,其结果是即使其内切酶位点碱基序列没有变化,但原有的内切酶位点相对位置发生变化从而导致RFLP。本次课将以蛋白质精氨酸甲基转移酶-6PRMT6rs12097821 SNP位点作为PCR扩增的对象,通过限制酶TaqaⅠ切割位点的有无,来区别野生型与突变型样本。

【讲解】10min

实验原理

聚合酶链式反应(PCR)是模拟体内DNA复制条件在体外酶促合成特异DNA片段的循环反应,可使目的DNA片段得以迅速扩增。其主要步骤是:将待扩增的模板DNA置于高温(约93~95℃)下使之变性解链;人工合成的两个寡核苷酸引物在低温(约50~70℃)下分别与目的DNA片段两侧的互补序列复性结合;引物在DNA聚合酶作用(约70~75℃)下沿模板按5’→3’方向延伸,合成目的DNA片段的新互补链。如此经过n个周期,理论上扩增2n倍,一般PCR30~40周期后可获得百万倍以上的目的DNA

聚合酶链式反应-限制酶片段长度多态(PCR-RFLP)分析技术是在PCR技术基础上发展起来的。如果DNA的突变位点发生在某种限制性内切酶的识别位点上,这段DNA就会增加或丢失该限制性酶的酶切点。利用这种限制性酶切割这段DNAPCR产物,野生型和突变体样本会产生长短不同的酶切产物,可以利用琼脂糖或聚丙烯酰胺凝胶电泳加以区分。 

 本实验选用人的蛋白质精氨酸甲基转移酶-6PRMT6作为PCR扩增的对象,以扩增产物中rs12097821 SNP位点[G/T],通过限制酶TaqaⅠ切割位点的有无来区别野生型与突变型样本。本实验的引物序列:F5'CGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACACAATATTTATGCTA

ATTGTCTTATTTTTACAAATGTAAATC  3'R5' ATGTGTCTGGTGCTTGAGGT  3'

PCR产物的长度为373bp TaqaI 酶切位点:TCGAGG:酶切为307bp66bp TT:不切,大小为373bpGT:酶切为373bp、 307bp66bp

【试剂与材料】5min

1、样本DNAPRMT6上下游引物、Taq DNA聚合酶、10×PCR反应缓冲液、4×dNTPs、限制性内切酶TaqⅠ、10×酶切反应缓冲液、2.5%琼脂糖、1×TBE6×上样缓冲液、DNA Marker 

2、微量加样器、PCR自动热循环仪。  

 

【实验步骤】10min

一、PCR反应

50ul反应体系成分如下: 

模板DNA100 ng/ml)      2ul

Taq DNA聚合酶mix         25ul

PRMT6上下游引物          各2ul

ddH2加至终体积          19ul

PCR反应循环参数: 

98℃ 1min30s

98℃ 5s

54℃ 5s

72℃ 5s

34个循环; 

72℃ 10s

反应结束后,置4℃保存。

【注意事项】

1、严格按照PCR反应体系和反应条件加样。 

【布置作业】1min

书写实验报告、讨论PCR-RFLP原理 

【辅导学生实验】90min):

教师巡回指导学生。

 

【总结实验】2min

板书提纲       

                                                                一、PCR-RFLP原理

二、PCR反应体系

三、PCR反应温度

 

 

 

 

 

 

 

 

 

提问:什么是PCR-RFLP,主要用途? 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

动画、视图、讲述

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

讲述、图示、总结

 

 

 

 

 

 

 

讲述

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

讲述

 

 

示图

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

表格展示

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

图示法

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

大标题保留至课终以便小结时用

 

次级标题、重要概念、要点保留至一个大问题讲完后擦掉

 

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