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实验3 RNA提取
2015-07-25 01:52  

        

 

2013 生物制药 本科班                               任课教师: 郝军莉

课程

分子生物学

实验技术

题目

RNA提取

学时

讲授

 

实验

3

练习

 

行课时间

201555 1-3

课次

3

 

生物化学与分子生物学实验,科学出版社,杨建雄,2008

 

ppt

 

 

 

1掌握动物组织和细胞中总RNA的提取和反转录为cDNA的方法和原理

2、熟悉RNA提取、反转录成cDNA所用试剂成分和作用

3、了解RNADNA提取的不同和区别

教学重点

难点及其

解决方案

教学重点动物组织RNA提取和反转录cDNA的方法和原理

教学难点: RNA提取、反转录成cDNA所用的试剂成分和作用

 

解决方案:RNA提取、反转录成cDNA所用试剂成分和作用详细讲解

 

 

1. 魏群 主编,分子生物学实验指导,高等教育出版社,2010

2. 郑伟娟 主编,现代分子生物学实验,高等教育出版社,2008

3. 李钧敏 主编,分子生物学实验,浙江大学出版社,2009

 

 

 

 

 

 

教研室主任签名:                                                                

 

        

教学过程、内容及时间分配

教学方法与手段

组织RNA提取、反转录成cDNA的实验原理

【实验目的】
1)学习并掌握动物组织总RNA的提取方法及其原理;掌握RNA反转录

cDNA的方法和原理。
2)从肝脏组织中提取到一定量的纯净的RNA样品并建立cDNA文库。
【实验原理】
RNA是一切生物细胞的重要组成成分,主要存在于细胞质中。通过液氮研磨动物肝脏,加入Trizol破碎细胞,抑制RNAase活性;氯仿可使蛋白质变性,离心除去DNA和变性蛋白质,RNA位于上层水相中;异丙醇沉淀RNA,溶于DEPC水中,在反转录酶、底物等的作用下,RNA反转录为cDNA

仪器、材料、试剂】
(一)仪器
高速离心机、烘箱、冰箱、微量移液器、高压灭菌锅、核酸分析仪、PCR
(二)材料
DEPCTrizol、氯仿、异丙醇、无水乙醇、75%乙醇、DEPC水、手术剪刀、镊子、吸水纸、微量取液器、研钵、液氮、1.5mL 离心管、200ul PCR管、Takara反转录试剂盒、一次性手套、口罩、1.5mL离心管架、记号笔

(三)试剂配制
175%乙醇:DEPC水稀释无水乙醇

2DEPC水:去离子水中加入0.1%DEPC水处理24 h,高压灭菌 
【实验步骤】

1、 细胞中加入1 ml Trizol颠倒混匀,室温放置5min,使其充分裂解。4 12,000g离心5min,去除沉淀。(注意:此时可放入-70℃长期保持。 

2、 200 ul 氯仿/ml Trizol加入氯仿,振荡混匀后室温放置2-3 min 

   (注意:此步一定要振荡混匀,使氯仿和Trizol不分层。)

3、 上层为无色水相和一个中间层。RNA主要在水相中,水相体积约为所用Trizol试剂的60%。(此步开始组长负责组织各组同步进行离心)

4、 吸取上层水相,至另一新的离心管中。400-450 ul 就足够了,千万不要贪多!  (注:千万不要吸取中间界面;若同时提取DNA和蛋白质,则保留下层酚相存于4℃冰箱,若只提RNA,则弃下层酚相。)

 

讲授5min

 

 

 

 

 

 

 

 

 

重点介绍40min

 

 

 

 

讲授10min

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

         

教学过程、内容及时间分配

教学方法与手段

5、 加入等体积异丙醇后,上下颠倒混匀,室温放置10 min 

6、 4 12,000g离心10 min,弃上清,离心后在管侧和管底出现白色沉淀。

7、 加入1 ml 75%乙醇,(切勿触及沉淀!)上下颠倒,温和振荡离心管。 

8、 4 12,000g离心5 min,尽量弃上清。 

9、 室温晾干或真空干燥5 min。(注:RNA样品不要过于干燥,否则很难溶解。)

10加入50 ulRNaseDEPC水,充分混匀。

11、按照Takara反转录试剂盒说明书,加入dNTP Mix (2.5mM Each)               4mlPrimer Mix 2 ml5×RT Buffer 4 mlRNAase inhibitor 2 mlHiFi-MMLV (200U/ml) 1 mlDEPC 4mlTotal RNA 3ml;共20ml体系。                                                                                

12充分混匀,反转录步骤在PCR仪中进行:42 50min(反转录反

应),70 15min (反转录酶失活反应), 4   ∞ cDNA保存于-20℃备用

实验操作

 


【注意事项】
1.抽提每一步用力要柔和,防止机械剪切力对RNA的损伤。
2.取上层清液时,注意不要吸起中间的DNA和有机相。
375%乙醇漂洗去乙醇时,不要荡起RNA
4.离心后,不要晃动离心管,拿管要稳,斜面朝外。

 

 

小结:RNA提取的注意事项和实验原理

简要板书

1. 动物组织RNA的提取、cDNA文库建立的实验原理

2. RNA提取方法

3. RNA提取试剂主要成分和作用

4. cDNA文库建立的原理

 

 

 

 

操作60min

 

 

 

 

 

 

讲授5min

 

 

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